anatomi terimi eski yunanca ana (içinden) ve tome yada temnein (kesmek) kelimelerinin birleştirilmesiyle oluşturulmuştur; keserek ayırma yada parçalama anlamına gelir.

tarihsel olarak bakıldığında mağara dönemi insan evladlarına kadar geriye gidebilirz ki bu dönemde yapılmış olan mağara çizimlerinde hayvan iç organı resimlerinin de olduğu görülmüştür. ilk yazılı kaynaklar ise eski yunan'da hippocrates ile başlar ( kafa kemikleriyle ilgili tanımları hala geçerliliğini korumaktadır) başka bir hekim aristotales ve ünlü yunan hekim galenos ( daha çok hayvan disseksiyonları üzerine çalışmıştır) ile devam eder. avrupa'daki yenilik hareketlerine takiben gelişme göstermiştir ki buna en iyi örnek leonardo da vinci'nin çalışmalarıdır; insan vücuduyla ilgili çizimleri günümüzde hala geçerliliğini korumaktadır. ancak onaltıncı yüzyılda bağımsız bir bilim dalı olarak ele alınmaya başlanan anatomi gelişimine daha da ivme alarak devam etmiştir; ilk anatomist ve modern anatominin kurucusu andreas vesalius çok sayıda kadavra üzerinde çalışmıştır.